Jednym z priorytetów Polskiej Rady Psychoterapii jest dbałość o standardy stosowania psychoterapii, zarówno ilościowe jak i jakościowe. Z uwagi na potrzebę ochrony pacjentów szczególnie ważne są zasady etyczne. Znajdują one odzwierciedlenie w kodeksach etycznych obowiązujących w poszczególnych stowarzyszeniach zrzeszających psychoterapeutów pracujących w oparciu o różne podejścia teoretyczne.
Najważniejszymi zasadami etycznymi są:
- psychoterapeuta respektuje integralność osób, którym pomaga oraz ich systemy wartości. Szanuje odrębność poglądów politycznych, filozoficznych i religijnych pacjenta, rzetelnie informuje w sytuacjach, kiedy poglądy i przekonania pacjenta mogą mieć związek z doświadczanymi problemami i uzgadnia z nim zakres możliwych zmian. Psychoterapeuta powstrzymuje się od indoktrynacji w tych obszarach. W przypadku wystąpienia znaczącego i nie pozwalającego na dalszą współpracę konfliktu pomiędzy systemem wartości pacjenta i psychoterapeuty, psychoterapeuta jest zobowiązany zakończyć psychoterapię i zaproponować pacjentowi podjęcie psychoterapii z innym psychoterapeutą;
- psychoterapeuta zachowuje tajemnicę zawodową. Oznacza to nieujawnianie danych osobowych pacjentów, informacji dotyczących ich spraw osobistych i stanu zdrowia (z wyjątkiem sytuacji określonych obowiązującymi przepisami);
- psychoterapeuta szanuje fizyczne granice pacjenta i tworzy bezpieczne, pełne zaufania środowisko dla jego psychoterapii. Oznacza to również powstrzymanie się od kontaktów seksualnych z pacjentami oraz od innych nadużyć, jakie mogłyby wynikać z wykorzystywania uprzywilejowanej roli, jaką pełnią psychoterapeuci;
- psychoterapeuta stale rozwija swoją wiedzę i dba o rozwój osobisty poprzez kształcenie, korzystanie z dorobku naukowego, psychoterapię własną i superwizję;
- psychoterapeuta jest odpowiedzialny za swój stan psychofizyczny w kontakcie z pacjentem, by móc jak najlepiej wykonywać swoją pracę. Dba o swoją psychofizyczną kondycję w stopniu, który umożliwia konstruktywne radzenie sobie ze stresem zawodowym oraz utrzymywanie wysokiej jakości swojej pracy.
Każde stowarzyszenie wchodzące w skład Polskiej Rady Psychoterapii posiada kodeks etyczny oraz procedury składania skarg i odwołań. Osoby będące członkami poszczególnych stowarzyszeń są zobowiązane do ich przestrzegania.